Segue abaixo análise em torno do cenário construído pelo time do projeto para testes do frete como custo planejado.
Pedido de Compras utilizado: 4500000862
A entrada da fatura não está conforme o pedido. Quando se utiliza chave de custo de frete no pedido, está sendo informado que o processo tem frete e que o mesmo é conhecido/planejado.
Conforme a imagem abaixo é possível verificar que a MIRO foi executada informando o valor no frete no campo de Custo de aquisição NÃO planejado. Esse procedimento é utilizado quando não existe a condição de frete no pedido.


Abaixo uma imagem de como deveria estar a MIRO para esse caso:

Deve estar configurada adequadamente a chave de custo para a determinação de contas FRE-FR1 na OBYC.